無需病毒載體,實現(xiàn)對人類T細胞高效、精準的基因改造,這是科學家們最新發(fā)表在Nature雜志上的突破成果。而“魔剪”CRISPR又在其中發(fā)揮了至關重要的作用。研究人員認為,這一成果對科研、醫(yī)學和工業(yè)領域具有重大意義,將大大加快下一代細胞療法的發(fā)展,為癌癥等疾病的治療帶來新希望。
病毒引發(fā)感染是通過注射它們自己的遺傳物質(zhì)。自上世紀70年代以來,科學家們就已經(jīng)開始運用病毒的這一特性:利用病毒載體運送DNA到細胞中,用于研究、基因療法等。
然而,構(gòu)建病毒載體其實是一個非常艱苦、昂貴的過程,臨床級載體(clinical-grade vectors)的短缺還導致了基因療法和細胞療法的生產(chǎn)瓶頸。此外,即使是可用的,病毒載體也遠不是一種理想的工具,因為它們會將基因隨意插入到細胞基因組中,這將損害現(xiàn)有的健康基因或使新引入的基因不受確保細胞正常運作的調(diào)節(jié)機制的控制。這些局限性可能會導致嚴重的副作用,已經(jīng)引起了人們對基因療法和細胞療法(如CAR-T)的擔憂。
擺脫“病毒”的新技術
7月11日,發(fā)表在Nature雜志上題為“Reprogramming human T cell function and specificity with non-viral genome targeting”的研究中,來自加州大學舊金山分校(UCSF)的科學家們開發(fā)出了一種在不使用病毒插入DNA的前提下就能“重寫”人類T細胞基因組的強大技術。
具體來說,該技術依賴于電穿孔:將一個電場應用于細胞,使得細胞膜暫時具有更大的滲透性。經(jīng)過一年的探索,UCSF的Alex Marson博士帶領的團隊發(fā)現(xiàn),當一定數(shù)量的T細胞、DNA和CRISPR被混合在一起,然后暴露于適當?shù)碾妶龊?,T細胞能夠精準整合特定的基因序列到基因組中被CRISPR切割的位點。
Alex Marson, MD, PhD, UCSF immunologist whose group has developed an approach to edit T cell genomes without using viruses, speaks with MD/PhD student Theo Roth. Credit: Noah Berger.
事實上,Marson博士實驗室的成員先前已經(jīng)在利用電穿孔和CRISPR插入少量遺傳物質(zhì)到T細胞中取得了一定程度的成功。但大量嘗試將長的DNA序列插入到T細胞中的實驗都失敗了:導致了細胞死亡。這使得很多研究人員認為,大的(長的)DNA序列對T細胞**過大。
為了展示新技術的多功能性和實力,Marson博士等利用它修復了T細胞中的一種致病基因突變,并且創(chuàng)造出了能夠找到和殺死人類黑色素瘤細胞的“定制T細胞”。
據(jù)論文第一作者Theodore L. Roth介紹,科學家們嘗試將新基因插入T細胞已有30年之久。在他們的研究中,經(jīng)過近一年的反復試驗,Roth確定了T細胞數(shù)量、DNA數(shù)量和CRISPR豐度(CRISPR abundance)的比值,結(jié)合擁有適當參數(shù)的電場,實現(xiàn)了對T細胞基因組高效、準確的編輯。
The research team created CRISPR guides that would cause green fluorescent protein to be expressed in only certain cellular locations and structures. Credit: Alex Marson's Lab.
“實力”驗證
研究中,Roth首先設計CRISPR用綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)標記一組不同的T細胞蛋白,結(jié)果證實,新技術具有高度的特異性,且脫靶效應水平非常低:GFP只在特定的細胞位置和結(jié)構(gòu)中表達。
接著,他們開始驗證新技術的治療前景。在第一個實驗中,Roth及其同事使用了由耶魯醫(yī)學院Kevan Herold提供給Marson博士實驗室的T細胞。這些細胞來自患罕見、嚴重自身免疫性疾病的三個兄弟姐妹。基因組測序顯示,這些兒童的T細胞攜帶著IL2RA基因的突變。而IL2RA基因編碼的是對調(diào)節(jié)性T細胞(Tregs,可抑制其他免疫細胞,阻止自身免疫)發(fā)育至關重要的一種細胞表面受體。
利用基于CRISPR的新技術,UCSF的團隊快速修復了兒童T細胞中的IL2RA缺陷,以及因突變受損的細胞信號。研究人員希望,就像利用CAR-T療法抗癌一樣,類似的技術能夠有效治療自身免疫性疾病。
在第二個實驗中,借助新技術,科學家們用“被專門設計用于識別人類黑色素瘤細胞特殊亞型的新受體”完全取代了“正常人類T細胞中的天然T細胞受體(T cell receptors,細胞用于檢測疾病和感染的傳感器)”。在培養(yǎng)皿中,被改造過的T細胞表現(xiàn)出了特異性:不僅能夠有效地找到目標黑色素瘤細胞,同時還會忽略其他細胞。這對于癌癥精準治療是非常重要的。
研究人員強調(diào),在不使用病毒載體的情況下,他們能夠生產(chǎn)出大量經(jīng)CRISPR改造后表達新T細胞受體的工程細胞。而將這些CRISPR工程細胞(CRISPR-engineered cells)移植給攜帶人類黑色素瘤的小鼠后,它們能夠進入腫瘤部位,并顯示出抗癌活性。
Set of test tubes in Alex Marson's lab. Credit: Noah Berger.
前景廣闊
Roth表示,由于新技術使得“在一周多一點的時間內(nèi)創(chuàng)建可用的定制T細胞系”成為了可能,因此,它已經(jīng)改變了Marson博士實驗室的研究環(huán)境。先前一些受限于病毒載體的實驗現(xiàn)在可以進行了。
“這是一種能夠用于改變、增強以及重編程T細胞的快速、靈活的方法。與速度和易用性一樣重要的是,新技術使得‘將大量的DNA片段插入T細胞中’成為了可能,這將賦予T細胞強大的新特性。”Marson博士評價道。
總結(jié)來說,研究人員希望,他們的新技術——一種基于CRISPR的快速、全能、經(jīng)濟的方法能夠在新興的細胞治療領域得到廣泛應用,加速開發(fā)新的、更安全的癌癥、自身免疫性疾病和其他疾?。òê币姷倪z傳性疾?。┑闹委煼椒?。
參考資料:
T Cell Engineering Breakthrough Sidesteps Need for Viruses in Gene-Editing——With Faster, Cheaper, More Precise Technique, Authors Say It’s ‘Off to the Races’ Toward New Cell Therapies
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