對復(fù)雜的基因組進(jìn)行深入研究，確定哪些基因翻譯蛋白質(zhì)，哪些基因不翻譯蛋白質(zhì)，以及對這些基因的分布和結(jié)構(gòu)進(jìn)行精準(zhǔn)描述等，是國際學(xué)界探尋生命奧秘的前沿課題之一。我國科研人員在該課題研究方面取得重要進(jìn)展，全新的研究成果已在線發(fā)布于國際期刊《分子植物》。
記者近日從中國科學(xué)院水生生物研究所了解到，該所葛峰研究員學(xué)科組利用蛋白基因組學(xué)的研究策略和方法，成功對單細(xì)胞光合真核生物三角褐指藻的基因組進(jìn)行了深度注釋，完成了三角褐指藻的蛋白質(zhì)組精細(xì)圖譜，并建立了完整的真核生物基因組深度注釋實驗技術(shù)和分析流程。
據(jù)該研究成果第一作者、高級實驗師楊明坤介紹，基因組是一種生物的所有遺傳信息，以往對基因組進(jìn)行深度注釋多采用生物信息學(xué)的方法，而與之相比，蛋白基因組學(xué)的方法更直接，也更可靠。
楊明坤說，蛋白質(zhì)是基因與生命活動的最終執(zhí)行者，運用蛋白基因組學(xué)的方法對基因組進(jìn)行深度注釋，不僅能夠發(fā)現(xiàn)新的蛋白質(zhì)，還能夠發(fā)現(xiàn)蛋白質(zhì)翻譯后修飾現(xiàn)象。此次團(tuán)隊的研究為三角褐指藻基因組的6628個基因提供了蛋白質(zhì)水平上的支持，并且發(fā)現(xiàn)1895個基因不翻譯蛋白質(zhì)。特別是，他們新發(fā)現(xiàn)了許多可以翻譯蛋白質(zhì)的基因，其中相當(dāng)一部分此前被學(xué)界認(rèn)為是長鏈非編碼的基因。
更為重要的是，該研究建立的實驗技術(shù)和分析流程，可適用于各種已經(jīng)完成基因組測序的真核生物，為真核生物基因組深度注釋提供了重要工具。
楊明坤說，蛋白基因組學(xué)從蛋白質(zhì)層面檢測蛋白表達(dá)變化、調(diào)控模式以及與疾病相關(guān)的基因突變。因此，該研究成果的取得，有望進(jìn)一步推動蛋白基因組學(xué)在生命和健康領(lǐng)域特別是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用。
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