研究結(jié)果以“Accurate Genomic Prediction of Human Height”為題發(fā)表在10月份的《Genetics》雜志上。該研究利用機(jī)器學(xué)習(xí)(計(jì)算機(jī)從數(shù)據(jù)中學(xué)習(xí))分析了英國(guó)近50萬(wàn)成年人的完整基因構(gòu)成。
值得注意的是,一種算法或者工具僅僅基于一個(gè)人的基因組就建立了諸如身高、骨密度甚至一個(gè)人可能達(dá)到的教育水平等人類特征的預(yù)測(cè)因子,這尚屬首次。而且它遠(yuǎn)不止于此。
“我們已經(jīng)為這三種結(jié)果驗(yàn)證了這個(gè)工具,現(xiàn)在可以應(yīng)用這種方法來預(yù)測(cè)與心臟病、糖尿病、乳腺癌等健康風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的其他復(fù)雜特征,”該研究的首席研究員Stephen Hsu說,“這只是個(gè)開始。該‘神器’的進(jìn)一步應(yīng)用或可以極大地促進(jìn)精準(zhǔn)醫(yī)療的實(shí)踐,使醫(yī)生能夠盡早干預(yù)病人的護(hù)理、預(yù)防或延緩疾病。”
在驗(yàn)證試驗(yàn)中,計(jì)算機(jī)準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)每個(gè)人的身高,雖然骨密度和受教育程度的預(yù)測(cè)值不那么精確,但它們的準(zhǔn)確性足以識(shí)別出那些骨密度極低可能與骨質(zhì)疏松癥相關(guān)或者是在學(xué)校里有掙扎危險(xiǎn)的人群。
傳統(tǒng)的基因檢測(cè)通常會(huì)檢測(cè)一個(gè)人的基因或染色體的特異性變化,這些變化可能表明患乳腺癌等疾病的風(fēng)險(xiǎn)更高。Hsu的模型考慮了大量的基因組差異,并基于成千上萬(wàn)的變異構(gòu)建了預(yù)測(cè)因子。
利用來自英國(guó)生物銀行的數(shù)據(jù),Hsu和他的團(tuán)隊(duì)將算法付諸實(shí)施,評(píng)估每個(gè)參與者的DNA,并教計(jì)算機(jī)找出這些明顯的差異。
Hsu說:“該算法著眼于每個(gè)人的遺傳構(gòu)成和身高。計(jì)算機(jī)向每個(gè)人學(xué)習(xí),并最終產(chǎn)生一個(gè)預(yù)測(cè)器,可以單獨(dú)從基因組上判斷他們的身高。”
Hsu的團(tuán)隊(duì)將繼續(xù)改進(jìn)算法,同時(shí)挖掘更大、更多樣化的數(shù)據(jù)集。這樣做將進(jìn)一步驗(yàn)證這些技術(shù),并繼續(xù)幫助繪制這些重要性狀和疾病風(fēng)險(xiǎn)的遺傳結(jié)構(gòu)。
Hsu補(bǔ)充道,隨著計(jì)算能力的提高和DNA測(cè)序成本的降低,過去被認(rèn)為是5到10年后的事情,現(xiàn)在已經(jīng)近在眼前了。
“我們的團(tuán)隊(duì)相信這是醫(yī)學(xué)的未來,”他說,“對(duì)患者來說,基因組檢測(cè)費(fèi)用只需50美元左右。一旦我們計(jì)算出遺傳性疾病的預(yù)測(cè)因子,早期干預(yù)可以節(jié)省數(shù)十億美元的治療費(fèi)用,更重要的是,還能挽救生命。”
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