相關(guān)成果以“A computational framework to integrate high-throughput ‘-omics’ datasets for the identification of potential mechanistic links”為題發(fā)表在《nature protocols》雜志。
主要作者、Orebro大學(xué)的Tuulia hytyleinen和Matej oresiq十多年來一直致力于代謝組學(xué)的研究,他們主要通過化學(xué)分析檢索與細(xì)胞代謝有關(guān)的數(shù)千分子的信息,并利用這種方法來研究腸道細(xì)菌代謝和糖尿病發(fā)展之間的聯(lián)系,部分成果已經(jīng)發(fā)表于2016年的《Nature》雜志上。
科學(xué)方法和結(jié)果一樣重要
代謝物是微觀分子,例如氨基酸、脂質(zhì)和糖分子,它們是新陳代謝的結(jié)果,借助Orebro大學(xué)研究人員使用的這種方法,可以從一份血樣中分析大約2000種代謝物。
“收集數(shù)據(jù)是分析的重要部分,但并不總是需要像實際數(shù)據(jù)分析那樣多的時間。這時候,大量收集的數(shù)據(jù)將需要與生物學(xué)和醫(yī)學(xué)問題聯(lián)系起來。” Orebro大學(xué)化學(xué)教授Tuulia hytyleinen說。
文中詳細(xì)介紹了研究(實驗)方法(working method protocol),通常情況下,一篇科學(xué)論文的方法部分對于其他研究人員來說是難以復(fù)制的,特別是在具有大量數(shù)據(jù)的復(fù)雜研究中。
作者強調(diào),科學(xué)方法和研究成果一樣重要。使用可靠的方法產(chǎn)生高質(zhì)量的數(shù)據(jù)非常關(guān)鍵。
防止麩質(zhì)不耐受(gluten intolerance)
目前,兩位研究人員正在研究幼兒的新陳代謝如何影響日后麩質(zhì)不耐受的發(fā)展。
麩質(zhì)不耐受并非一個被嚴(yán)格定義的名詞,經(jīng)常會和麩質(zhì)過敏混用,醫(yī)學(xué)上更明確的叫法是乳糜瀉(celiac disease)。
對于乳糜瀉患者,攝入gluten以后,自身免疫系統(tǒng)就會產(chǎn)生抗體進而攻擊患者的小腸絨毛,而小腸絨毛受到攻擊后會變得扁平,從而顯著減少與食物的接觸面積,造成營養(yǎng)吸收不良。
“在嬰兒通過飲食接觸gluten之前,我們已經(jīng)看到了他們體內(nèi)脂質(zhì)代謝的變化。這一發(fā)現(xiàn)或許能更好地理解麩質(zhì)不耐受的發(fā)展,或許有助于我們預(yù)防這種疾病。” Matej oresiq補充道。
此外,他們還在調(diào)查早期接觸各種環(huán)境污染物與1型糖尿病發(fā)展之間的關(guān)系。
“我們正在努力尋找可能用于各種疾病診斷的生物標(biāo)記物,以研究腸道細(xì)菌產(chǎn)生的代謝產(chǎn)物以及這些代謝產(chǎn)物是如何影響我們的新陳代謝的。需要指出的是,從采集樣本到數(shù)據(jù)分析,我們正在不斷改進整個分析鏈,以便讓其他研究人員也能使用我們的方法。” Matej oresiq總結(jié)道。
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