12月21日,頂級(jí)期刊Science評(píng)選出“2018年度十大科學(xué)突破”,其中7項(xiàng)成果與生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域相關(guān),而“追蹤單細(xì)胞發(fā)育譜系”(Development cell by cell)榮登年度突破之首。
這份榜單末尾,有一個(gè)特殊版塊——“負(fù)面事件”(BREAKDOWNS),上月爭(zhēng)議得沸沸揚(yáng)揚(yáng)的“首例基因編輯嬰兒”事件因?yàn)榈赖隆惱頁?dān)憂而被納入其中。
單個(gè)細(xì)胞的發(fā)育過程
一個(gè)受精卵究竟是如何產(chǎn)生構(gòu)成完整身體的多種細(xì)胞類型、組織和器官的?這是生物學(xué)領(lǐng)域的謎題之一。如今,結(jié)合單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)和新型計(jì)算工具,來自哈佛大學(xué)、Broad研究所等機(jī)構(gòu)的科學(xué)家們提供了關(guān)于這一過程最詳細(xì)的圖片。4月26日,Science雜志用3篇論文報(bào)道了這一突破性成果。
我們知道, DNA是協(xié)調(diào)細(xì)胞增殖、分化的基礎(chǔ)。所以,靶向單細(xì)胞內(nèi)的基因(何時(shí)表達(dá)、誘導(dǎo)細(xì)胞分化),最終能夠拼湊出胚胎發(fā)育的細(xì)節(jié)。
具體而言,這一探究過程分成了“三部曲”:首先,研究團(tuán)隊(duì)從生物體中分離出數(shù)千個(gè)完整的細(xì)胞;隨后,對(duì)每個(gè)細(xì)胞的遺傳物質(zhì)進(jìn)行有效的測(cè)序;最后,利用計(jì)算機(jī)或細(xì)胞標(biāo)記工具,重建這些細(xì)胞的時(shí)間與空間關(guān)系。
得益于這一系列技術(shù),科學(xué)家們描繪出胚胎發(fā)育的驚人細(xì)節(jié),以前所未有的清晰度,看清單個(gè)細(xì)胞的發(fā)育過程。他們已弄清楚扁蟲、青蛙、斑馬魚等多種動(dòng)物的發(fā)育過程,證實(shí)斑馬魚最初的單細(xì)胞胚胎能夠產(chǎn)生25種主要的細(xì)胞類型。
發(fā)育生物學(xué)家曾經(jīng)認(rèn)為,一旦一個(gè)細(xì)胞開始沿著一個(gè)方向發(fā)展(如發(fā)育成一個(gè)肌肉細(xì)胞),那它就不會(huì)“偏離”這個(gè)方向。然而,這項(xiàng)新研究發(fā)現(xiàn),一些斑馬魚細(xì)胞會(huì)在“半路”轉(zhuǎn)向另一個(gè)發(fā)展方向。
科學(xué)家們認(rèn)為,這部“樂章”將改變未來10年的生物學(xué)研究。而單細(xì)胞革命才剛剛開始。
首個(gè)基因沉默藥物獲批上市(Gene-silencing drug approved)
今年8月,F(xiàn)DA宣布批準(zhǔn)第一款基于RNA干擾(RNAi)技術(shù)的治療藥物——patisiran,適用于一種損傷心臟、神經(jīng)功能的罕見病。
Patisiran由Alnylam公司研發(fā),通過沉默與罕見疾病——遺傳性轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白淀粉樣變性(hereditary transthyretin amyloidosis)有關(guān)的基因,阻止突變的轉(zhuǎn)甲狀腺素蛋白(TTR)在體內(nèi)積累,進(jìn)而防止心臟和神經(jīng)功能受損。
1998年,科學(xué)家們首次在線蟲體內(nèi)證實(shí)RNA干擾沉默基因的成果。2002年,Alnylam成立。4年后,RNAi領(lǐng)域的兩位杰出科學(xué)家——斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Andrew Fire、馬薩諸塞大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Craig Mello榮獲諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。
這是自20年前RNAi技術(shù)(可以針對(duì)性沉默與疾病相關(guān)的特定基因,從而阻止致病蛋白的表達(dá))被發(fā)現(xiàn)以來,首個(gè)被證實(shí)有臨床價(jià)值并獲批上市的RNAi藥物。
分子“CT”(Molecular structures made simple)
2018年10月,兩個(gè)研究團(tuán)隊(duì)同時(shí)發(fā)表論文,揭示了一種新的方法,可以在短短幾分鐘內(nèi)確定小有機(jī)化合物的分子結(jié)構(gòu),打破了傳統(tǒng)方法要求的幾天、幾周或幾個(gè)月的“時(shí)間界限”。
他們向微小的3D晶體發(fā)射電子束,并跟蹤每次輕微旋轉(zhuǎn)時(shí)衍射圖案的變化情況,從而能夠在幾分鐘內(nèi)生成3D晶體的分子結(jié)構(gòu)。這項(xiàng)技術(shù)非常適用于繪制激素和潛在藥物的小分子結(jié)構(gòu)。
學(xué)界評(píng)價(jià)說:這是小分子化學(xué)結(jié)構(gòu)鑒定的顛覆性突破,對(duì)于未來藥物的研發(fā)、分子探針的設(shè)計(jì)以及疾病病理的解析都有著重要意義。
古老的人類“混血兒”(An archaic human ‘hybrid’)
今年,來自于德國馬克斯•普朗克人類演化研究所的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表了一項(xiàng)重要成果:他們發(fā)現(xiàn)了一塊非凡的古代混血遺骸——其父親是尼安德特人,母親是丹尼索瓦人。他們大約生活在90000年前,都是早已滅絕的人類。
其中,尼安德特人主要居住在歐洲,丹尼索瓦人曾遍布亞洲。而這塊骨骼的擁有者被證實(shí)是丹尼索瓦人和尼安德特人的第一代混血后代。
一位遺傳學(xué)家評(píng)價(jià)道:“在諸多接受了基因組測(cè)序的人類中,她可能是有史以來最令人著迷的。”
法醫(yī)系譜學(xué)走向成熟(Forensic genealogy comes of age)
Joseph James DeAngelo是一名臭名昭著的罪犯,在上世紀(jì)70年代和80年代共犯下12起謀殺案、45起強(qiáng)奸案和120起入室行竊案。但是,警察們卻無法確定嫌疑犯,因?yàn)檫@名兇手被稱為暗夜尾隨者和“金州殺手”(Golden State Killer)。
為了捉到他,警察們求助了一項(xiàng)強(qiáng)大“武器”——通過遺傳系譜來識(shí)別罪犯。通過將犯罪現(xiàn)場(chǎng)的DNA檔案上傳到GED match(系譜學(xué)家共享的公共數(shù)據(jù)庫)上。隨后,他們找到了兇手的第三代或第四代表親,并建立了兇手的家譜,最終鎖定兇手。
借助于“法醫(yī)系譜學(xué)”,執(zhí)法機(jī)構(gòu)已經(jīng)成功解決了約20起之前難以破解的謎案。
雖然關(guān)于這一策略背后的侵犯隱私問題一直存在爭(zhēng)議,但是“金州殺手”案件讓大家達(dá)成一致,至少系譜學(xué)可以用于鑒定暴力型罪犯。
原始世界的分子窗口(Molecular windows into primeval worlds)
今年9月,Science期刊發(fā)表了一篇文章揭示,在一塊距今6.35-5.41億年前 億年前生物化石(狄更遜水母,Dickinsonia)中發(fā)現(xiàn)了膽固醇分子,這是動(dòng)物生命的標(biāo)志。科學(xué)家們確認(rèn),這種生物是地球上已知最古老的動(dòng)物之一。
隨后的10月,另一研究團(tuán)隊(duì)在來自6.6-6.35億年前的巖石中發(fā)現(xiàn)了一種僅由海綿構(gòu)成的分子痕跡。這意味著,海綿這種形式的動(dòng)物生命形式,可能比已有最古老的化石早進(jìn)化了一億年。
細(xì)胞內(nèi)的“相分離”(How cells marshal their contents)
細(xì)胞是構(gòu)成生命體的基礎(chǔ)單位,其內(nèi)的各組分是如何協(xié)調(diào),以確保在正確的時(shí)間、地點(diǎn)行使生理功能的?科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),這與細(xì)胞內(nèi)的液滴(Liquid droplet)有關(guān)。最新研究發(fā)現(xiàn),液滴在細(xì)胞中無處不在。
從2009年開始,科學(xué)家們就已發(fā)現(xiàn),細(xì)胞內(nèi)的許多蛋白質(zhì)能夠分離或濃縮成離散的液滴。
這種“液-液相分離”類似于油和醋在醬汁中的“分離”是細(xì)胞生物學(xué)中最熱門的話題之一,因?yàn)橛凶C據(jù)表明,這種分離促進(jìn)了關(guān)鍵的生化反應(yīng),似乎是細(xì)胞的基本組織原理。
今年,Science期刊上的3篇論文表明,這種“相分離”負(fù)責(zé)驅(qū)動(dòng)DNA轉(zhuǎn)錄為RNA。
負(fù)面事件:基因編輯嬰兒
值得一提的是,在前兩日Nature期刊推出的“2018年度十大人物”榜單中,因?yàn)?ldquo;首例基因編輯嬰兒”事件在整個(gè)學(xué)界乃至全球掀起爭(zhēng)議的賀建奎名列其中。
Science認(rèn)為,這是一個(gè)充滿倫理爭(zhēng)議的主張。
人類重寫自己的遺傳密碼是一項(xiàng)不小的成就。另一方面,在不同的環(huán)境下,種系基因編輯很有可能成為今年科學(xué)的突破。但是“編輯嬰兒”明顯打破了生物倫理的底線。
事件公開后,賀建奎只在第二屆人類基因組編輯國際峰會(huì)上露過一次面,至今毫無消息。
賀建奎用一種被稱為CRISPR的基因編輯技術(shù)改變了嬰兒的基因組,目的是為了保護(hù)孩子不受HIV感染。但事實(shí)上,業(yè)界權(quán)威人士認(rèn)為,賀建奎的試驗(yàn)沒有任何意義,而且是不道德的、不應(yīng)該做的。
學(xué)界認(rèn)為,他的“冒進(jìn)”打破了關(guān)于生殖細(xì)胞試驗(yàn)的共識(shí),也違反了嚴(yán)重違反了中國相關(guān)法規(guī)、規(guī)定和指南(絕不應(yīng)開展和資助此類研究)。
寫在最后
這一評(píng)選是Science每年的傳統(tǒng),他們會(huì)邀請(qǐng)記者、編輯和業(yè)界人士推選年度“突破”成就或科學(xué)發(fā)現(xiàn),并讓廣大讀者進(jìn)行投票。所以,這一榜單也被認(rèn)為是“the People's Choice—along with Science's choice”。
在今年的“投票環(huán)節(jié)中”,單細(xì)胞發(fā)育、基因沉默藥物分別以35%、30%的占比贏得了第一、二名。2018年已接近尾聲,這些科學(xué)成就還只是一個(gè)個(gè)新的開始,未來,它們終將在生命醫(yī)學(xué)史上留下更多的印記……
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