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CPHI制藥在線 資訊 江湖奧義 抗體優(yōu)化

江湖奧義 抗體優(yōu)化

作者:灰黃豆  來源:藥渡
  2021-06-24
自1986年FDA批準(zhǔn)的第 一個(gè)鼠源性單抗藥物Orthoclone Okt3以來,抗體治療發(fā)展如火如荼,至此抗體類藥物的批準(zhǔn)數(shù)量已經(jīng)接近每年批準(zhǔn)藥物總數(shù)的1/5,截止5月,已有100種單抗獲批,有200多種治療用抗體處于臨床研究階段。

       自1986年FDA批準(zhǔn)的第 一個(gè)鼠源性單抗藥物Orthoclone Okt3以來,抗體治療發(fā)展如火如荼,至此抗體類藥物的批準(zhǔn)數(shù)量已經(jīng)接近每年批準(zhǔn)藥物總數(shù)的1/5,截止5月,已有100種單抗獲批,有200多種治療用抗體處于臨床研究階段。

       縱觀國(guó)內(nèi)外市場(chǎng),抗體藥物市場(chǎng)增長(zhǎng)迅速,潛力巨大。拒估測(cè),到2023年全球抗體市場(chǎng)可達(dá)到近4000億美元的體量,我國(guó)抗體市場(chǎng)規(guī)模也直沖3000億元。多方藥企加入這場(chǎng)角力,競(jìng)爭(zhēng)逐日白熱化。

       無論何時(shí)何地,要想在競(jìng)爭(zhēng)中拔得頭籌,必然不是蠻干,古有孫臏善用差別競(jìng)爭(zhēng),今有計(jì)算機(jī)加持改造,在抗體賽道中脫穎而出,必然離不開抗體優(yōu)化,本文就以安全性和功效兩個(gè)方面展開敘述。

       降低免疫原性

       由小鼠、大鼠或者其他動(dòng)物所產(chǎn)生的抗體對(duì)人體來說都具有免疫原性,如果不對(duì)其施以措施降低免疫原性的話,身體會(huì)產(chǎn)生抗抗體藥物的抗體,阻礙治療。

       單克隆抗體根據(jù)其序列來源分為四種:鼠源、嵌合(鼠可變區(qū)序列加入恒定序列)、人源化(人序列具有鼠互補(bǔ)決定區(qū))和全人(抗體來自能產(chǎn)生人抗體的轉(zhuǎn)基因鼠或者來自人B細(xì)胞)。

       就以嵌合抗體來說,可以對(duì)其可變區(qū)進(jìn)行修飾,通過替換某些位點(diǎn)上的氨基酸來提高與人體天然抗體的相似性,這個(gè)過程就叫做“抗體人源化”,當(dāng)然這一步驟的前提是不影響抗體對(duì)抗原的親和力??贵w人源化是一種廣泛應(yīng)用的減少免疫系統(tǒng)產(chǎn)生外源反應(yīng)的的一種方法。

       目前被廣泛使用的人源化方法有三種:計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)、噬菌體展示和酵母展示。計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)先建立鼠源抗體的三維模型結(jié)構(gòu),用電腦軟件來分析結(jié)構(gòu)和設(shè)計(jì)突變。

       噬菌體展示和酵母展示則是通過建庫(kù)和篩庫(kù)來進(jìn)行的。

       傳統(tǒng)的抗體開發(fā)方式,是使用抗原對(duì)小鼠免疫接種,獲得可以持續(xù)分泌抗體的的雜交瘤細(xì)胞,在篩選后使用選定的先導(dǎo)物生成嵌合或人源化抗體。而噬菌體展示,則是在人類抗體文庫(kù)中選擇候選抗原,在經(jīng)過3-5輪生物淘選后,通過ELISA篩選免疫陽性噬菌體,然后分析它的DNA序列,選擇人源化程度最高、其他屬性也最好的序列作為治療用抗體的候選序列。像阿達(dá)木單抗就是使用噬菌體展示的技術(shù)。

       但是努力不光止于此,還有一種誘導(dǎo)免疫耐受的方法。這就不得不說下適應(yīng)性免疫了。T細(xì)胞和B細(xì)胞的記憶和效應(yīng)功能是通過識(shí)別同源抗原中稱為表位的部分來進(jìn)行的,其中對(duì)T細(xì)胞表位的預(yù)測(cè)要優(yōu)于B細(xì)胞表位預(yù)測(cè),B細(xì)胞表位預(yù)測(cè)容易引發(fā)不與天然抗原交叉反應(yīng)的抗體。

       T細(xì)胞表位由I類(MHC I)和II(MHC II)MHC分子呈現(xiàn),其分別被兩個(gè)不同的T細(xì)胞亞群CD8和CD4 T細(xì)胞識(shí)別。在表位識(shí)別后,CD8 T細(xì)胞變成細(xì)胞**T淋巴細(xì)胞(CTL),與此同時(shí),引發(fā)CD4 T細(xì)胞成為輔助(Th)或調(diào)節(jié)(Treg)T細(xì)胞。

       而誘導(dǎo)免疫就是就是通過將Treg 表位引入抗體,因?yàn)門reg 表位將刺激Treg 功能并誘導(dǎo)其對(duì)抗體產(chǎn)生免疫耐受,當(dāng)活化的T細(xì)胞被抑制后,對(duì)抗體的耐受性就會(huì)增加。

       抗體親和力成熟

       對(duì)于抗原的親和力對(duì)于候選抗體來說,是一個(gè)很重要的考量方面,因?yàn)槿绻B結(jié)合都困難的話,更別說是起作用了,起效的前提一定是結(jié)合,但是結(jié)合了不一定就起作用。結(jié)合也有強(qiáng)有弱,我們用親和力來評(píng)估結(jié)合能力的強(qiáng)弱,親和力越強(qiáng),解離平衡常數(shù)就越小,俗話說,就是越難舍難分。

       親和力成熟是指機(jī)體正常存在的一種免疫功能狀態(tài),在體液免疫中,再次應(yīng)答所產(chǎn)生抗體的平均親和力高于初次免疫應(yīng)答。當(dāng)分離出一組先導(dǎo)抗體的時(shí)候,必然要對(duì)其結(jié)合親和力進(jìn)行優(yōu)化。對(duì)抗體Fv 片段修飾可以采用隨機(jī)誘變、靶向誘變重親鏈洗牌重配和電腦模擬設(shè)計(jì),這些方法已經(jīng)被證實(shí)可以有效的提升親和力。

       體外親和力成熟的過程需要耗費(fèi)大量時(shí)間和精力,目前所采用的策略通?;诮Y(jié)構(gòu)原理或者是小型文庫(kù)途徑,這些方法成功的原因依托于以下兩個(gè)方面的因素:

       1,高質(zhì)量的共晶結(jié)構(gòu)的存在。

       2,可計(jì)算突變發(fā)生時(shí)候能量變化的算法。

       傳統(tǒng)的親和力優(yōu)化過程可能會(huì)花費(fèi)至少6個(gè)月的時(shí)間,但是當(dāng)計(jì)算策略和與重點(diǎn)試驗(yàn)評(píng)估兩者相結(jié)合的時(shí)候,可以節(jié)省很多時(shí)間,再一個(gè)就是如果依托經(jīng)典的晶體結(jié)構(gòu)來進(jìn)行計(jì)算機(jī)模擬親和力成熟而不是制造實(shí)際的抗原-抗體共晶結(jié)構(gòu)的話,也可以節(jié)省大量時(shí)間。當(dāng)然在一些傳統(tǒng)的方法比如文庫(kù),誘變中,共晶體結(jié)構(gòu)甚至可以提高親和力達(dá)到10~100倍以上,而在缺乏抗原-抗體共晶結(jié)構(gòu)下,計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)其實(shí)相當(dāng)具有挑戰(zhàn)性。

       這里有一個(gè)思維慣性,那就是親和力不是越高越好嗎,其實(shí)不然,大多數(shù)情況,我們還是需要根據(jù)藥物的實(shí)際機(jī)理作用來調(diào)整它的親和力,從而使得藥效達(dá)到最大化。其實(shí)這有點(diǎn)像二次函數(shù)曲線,我們需要找到那個(gè)頂點(diǎn)。

       提升親和力是優(yōu)化的步驟,但是親和力太高也容易造成一些麻煩,就以實(shí)體瘤為例子來說明一下吧,抗體親和力太強(qiáng)的話可能會(huì)導(dǎo)致大分子抗體只能在實(shí)體瘤附近高濃度聚集,妨礙了抗體在其部位的擴(kuò)散,不利于藥效發(fā)揮其最大效果。另外一個(gè)點(diǎn)就是,還要考慮到抗體在不同的PH環(huán)境下面具有不同的親和力,這有利于它一些功能的發(fā)揮,比如說某些抗體在溶酶體等這樣一些細(xì)胞內(nèi)的酸性條件下容易解離擴(kuò)散的話,是不是就可以釋放某些與它結(jié)合的受體,讓這些被釋放的受體可以重新回到細(xì)胞表面發(fā)揮介導(dǎo)作用。

       特異性優(yōu)化

       為了降低抗體對(duì)其他抗原的交叉反應(yīng)性,擴(kuò)大抗體對(duì)相關(guān)抗原的特異性或改善抗體對(duì)不同物種抗原的結(jié)合力,需要對(duì)抗體進(jìn)行工程改造以優(yōu)化其特異性。隨機(jī)誘變和靶向誘變是2 種常用優(yōu)化抗體特異性的方法。

       如果有抗體-抗原復(fù)合物的3D 結(jié)構(gòu)可參考,也可將人表位突變?yōu)榱硪环N種系的表位(例如猴表位或鼠表位),通過使用軟件的“親和力成熟功能”來預(yù)測(cè)和引入能優(yōu)化異種抗原親和力的突變。

       IgG 是最豐富的一類抗體,它們構(gòu)成了大約 75% 的血清免疫球蛋白庫(kù)。提高抗體的抗原結(jié)合能力主要由IgG的可變區(qū)決定。IgG 是由兩條輕鏈和兩條重鏈組成,輕鏈包含可變(V L)和恒定(C L)域,重鏈包含一個(gè)可變(V H)和三個(gè)恒定(C H 1、C H 2 和C H 3)域。IgG 的多域性質(zhì)巧妙地將其生物活性劃分為不同的子域??乖Y(jié)合片段 (Fab) 包含兩個(gè)可變域,并通過稱為互補(bǔ)決定區(qū) (CDR) 的六個(gè)肽環(huán)介導(dǎo)抗原識(shí)別。相比之下,可結(jié)晶片段 (Fc) 包含恒定域(C H 2 和 C H 3),其通過與免疫受體分子(例如補(bǔ)體蛋白和 Fc 受體)結(jié)合來介導(dǎo)效應(yīng)子功能。

       抗體優(yōu)化當(dāng)然不止這幾個(gè)方面,在其他方面,比如說構(gòu)象穩(wěn)定性、溶解度、生物效應(yīng)等都是十分重要的,由于本文篇幅限制,就不一一展開講了。

       如果能夠明確參與發(fā)病機(jī)制的特定蛋白質(zhì)或者分子的話,抗體毫無疑問是有效的治療選擇之一。這么多年的發(fā)展下來,現(xiàn)在市場(chǎng)上的治療性抗體大致可以分為這么兩大類——

       第 一類是直接用裸抗體進(jìn)行疾病治療,此類抗體通過直接靶向癌細(xì)胞誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡、靶向腫瘤微環(huán)境(阻斷癌細(xì)胞的營(yíng)養(yǎng)供應(yīng))、靶向免疫檢查點(diǎn)(阻止免疫逃逸)和介導(dǎo)通路(例如 ADCC/CDC,在介導(dǎo)路徑中,招募其他免疫細(xì)胞來殺死癌細(xì)胞)等機(jī)制來引發(fā)細(xì)胞死亡。

       第二類是對(duì)裸抗體進(jìn)行了額外的修飾從而以增強(qiáng)其治療效果。這方面的例子有免疫細(xì)胞因子(選定的細(xì)胞因子與抗體融合來增強(qiáng)遞送特異性)、抗體-藥物偶聯(lián)物 (ADC,增強(qiáng)藥物的遞送,減少對(duì)非靶向組織的非特異性毒副作用)、抗體-**核素偶聯(lián)物 (ARC,定位放射治療)、雙特異性抗體(增強(qiáng)特異性靶向)、免疫脂質(zhì)體和 CAR-T。

       當(dāng)我們?cè)俅位貧w單抗發(fā)展的歷史,不難發(fā)現(xiàn)其實(shí)幾乎每一年都有新的突破發(fā)生,相信伴隨著科技的進(jìn)一步發(fā)展,計(jì)算能力和速度的提升以及三維蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的擴(kuò)大,精準(zhǔn)治療的效率與進(jìn)展可以得到更進(jìn)一步的提升和加速。

       參考文獻(xiàn):

       1,https://academic.oup.com/abt/article/4/1/45/6142994?search result=1#229867976

       2,https://www.hindawi.com/journals/jir/2017/2680160/

       3,Cannon DA, Shan L, Du Q, Shirinian L,Rickert KW, Rosenthal KL, et al. (2019) Experimentally guided computational antibody affinity maturation with de novo docking, modelling

       and rational design. PLoS Comput Biol 15(5):e1006980.

       4,https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6939334/

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