對(duì)于小分子化學(xué)創(chuàng)新藥,結(jié)構(gòu)是一切藥物特點(diǎn)的基礎(chǔ)。但,之所以存在如此多的“me-too”藥物,就是因?yàn)橥?lèi)藥物很難逃脫已報(bào)導(dǎo)的本領(lǐng)域技術(shù)人員可推測(cè)的成藥結(jié)構(gòu)范圍。為了即獲得知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù),又突破行業(yè)傳統(tǒng)的“me-too”眼光,并同時(shí)具備很高的成藥屬性,大環(huán)結(jié)構(gòu)越來(lái)越多的被應(yīng)用到結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)當(dāng)中,今天就通過(guò)幾個(gè)例子,來(lái)和大家共同感受下大環(huán)結(jié)構(gòu)對(duì)于小分子化學(xué)藥物結(jié)構(gòu)突破的重要性。
1.舊事重提 EGFR經(jīng)典結(jié)構(gòu)
化學(xué)創(chuàng)新藥,結(jié)構(gòu)是一切藥物特點(diǎn)的基礎(chǔ)。但,之所以存在如此多的“me-too”藥物,就是因?yàn)橥?lèi)藥物很難逃脫已報(bào)導(dǎo)的本領(lǐng)域技術(shù)人員可推測(cè)的成藥結(jié)構(gòu)范圍。為了即獲得知識(shí)產(chǎn)權(quán)保護(hù),又突破行業(yè)傳統(tǒng)的“me-too”眼光,并同時(shí)具備很高的成藥屬性,大環(huán)結(jié)構(gòu)越來(lái)越多的被應(yīng)用到結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)當(dāng)中,今天就通過(guò)幾個(gè)例子,來(lái)和大家共同感受下大環(huán)結(jié)構(gòu)對(duì)于小分子化學(xué)藥物結(jié)構(gòu)突破的重要性。
每當(dāng)說(shuō)到大環(huán)、扣環(huán),就不得不說(shuō)說(shuō)肺癌經(jīng)典靶標(biāo)EGFR的2個(gè)重磅藥物,厄洛替尼和埃克替尼,這也是業(yè)內(nèi)人士談環(huán)必談的兩個(gè)結(jié)構(gòu),我們先溫習(xí)下這兩個(gè)藥物。
? 厄洛替尼
EGFR抑制劑,開(kāi)發(fā)公司為羅氏公司的基因泰克和安斯泰來(lái),首批時(shí)間為2004年(FDA),商品名Tarceva,該藥臨床主要用于非小細(xì)胞肺癌的治療。Tarceva為口服片劑,每片含25 mg、100 mg或150 mg厄洛替尼。推薦劑量對(duì)于非小細(xì)胞肺癌,每次150 mg,每日1次,空腹服用。
?埃克替尼
開(kāi)發(fā)公司為貝達(dá)藥業(yè)(Beta),首批時(shí)間為2011年(CFDA),商品名為Conmana/凱美納,為EGFR具有敏感基因突變的局部晚期或轉(zhuǎn)移性非小細(xì)胞肺癌的一線(xiàn)治療。Conmana/凱美納為口服片劑,每片含有125mg埃克替尼;推薦劑量為成人每次125 mg,每日3次。
那么,以今天的眼光來(lái)看這兩個(gè)結(jié)構(gòu),對(duì)于本領(lǐng)域技術(shù)人員來(lái)說(shuō),可能不算很大的突破,但在曾經(jīng)的那個(gè)年代,最終可以開(kāi)發(fā)為國(guó)內(nèi)創(chuàng)新藥的重磅級(jí)品種,算是很能代表當(dāng)時(shí)國(guó)內(nèi)新藥研發(fā)的創(chuàng)新技術(shù)水平。
2.大環(huán)結(jié)構(gòu)可能產(chǎn)生的技術(shù)效果
大環(huán)僅僅是為了突破專(zhuān)利嗎?從結(jié)構(gòu)的角度來(lái)說(shuō),是可以突破新穎性的,但以今天本領(lǐng)域技術(shù)人員的專(zhuān)業(yè)性來(lái)看,很難突破創(chuàng)造性。那么,就必須找到一些意想不到的技術(shù)效果,比如一些其他成藥性特點(diǎn)的突破,下面舉幾個(gè)例子。
? 活性舉例
BACE抑制劑的開(kāi)發(fā)過(guò)程,有研究者對(duì)蛋白進(jìn)行了研究分析,并以此設(shè)計(jì)了大環(huán)環(huán)合結(jié)構(gòu),活性得到了明顯的提升,如下圖所示。
圖2.1 大環(huán)結(jié)構(gòu)-活性提升
? 選擇性舉例
下述大環(huán)類(lèi)氨基嘧啶化合物作為多靶點(diǎn)CDK和VEGFR抑制劑具有良好的生物活性,同時(shí),在大環(huán)骨架連接區(qū)做結(jié)構(gòu)修飾,通過(guò)磺胺基的引入可以影響化合物對(duì)靶點(diǎn)的選擇性,結(jié)構(gòu)如下圖所示。
圖2.2 大環(huán)結(jié)構(gòu)-選擇性提升
? 理化性質(zhì)舉例
有研究者報(bào)道了JAK2和FLT3大環(huán)抑制劑,適應(yīng)癥指向骨髓纖維化和淋巴瘤;在大環(huán)骨架上進(jìn)行不同的取代基修飾,水溶性得到了很好地提升;當(dāng)然,這個(gè)例子主要是介紹在大環(huán)成環(huán)后,側(cè)鏈的修飾。
圖2.3 大環(huán)結(jié)構(gòu)-理化性質(zhì)提升
3.大環(huán)結(jié)構(gòu)成功案例
首先,有研究者對(duì)近10年左右的大環(huán)類(lèi)上市藥物進(jìn)行了梳理(詳見(jiàn)下表),上市品種分布于各個(gè)適應(yīng)癥領(lǐng)域,大家可根據(jù)各自的研究方向進(jìn)行檢索學(xué)習(xí)。
這里,筆者對(duì)上述幾個(gè)品種及其他臨床在研品種進(jìn)行簡(jiǎn)單的介紹,進(jìn)一步共同學(xué)習(xí)大環(huán)結(jié)構(gòu)獲得成功的案例。
? 開(kāi)鏈克唑替尼vs大環(huán)勞拉替尼
開(kāi)發(fā)公司均為輝瑞,但時(shí)間相差了7年??诉蛱婺?,首次上市時(shí)間為2011年,為間變性淋巴瘤激酶ALK抑制劑,藥物療效不錯(cuò),但存在耐藥和難以進(jìn)入中樞的缺點(diǎn)。為此,研制出升級(jí)品種勞拉替尼,于2018年獲批上市。結(jié)構(gòu)優(yōu)化過(guò)程見(jiàn)下圖。
圖3.1 從克唑替尼到勞拉替尼
? EGFR大環(huán)抑制劑BI-4020
開(kāi)發(fā)公司為勃林格殷格翰,最初的先導(dǎo)化合物(IC50為微摩爾級(jí)別)源于三突變EGFR(EGFRdeI19/T790M/C797S)和野生EGFR蛋白對(duì)化合物的篩選,后逐漸優(yōu)化,得到了大環(huán)化合物BI-4020。結(jié)構(gòu)優(yōu)化過(guò)程見(jiàn)下圖。
圖3.2 EGFR大環(huán)抑制劑BI-4020的結(jié)果演變
? 凝血因子FXIa抑制劑
XIa因子是繼Xa因子后,現(xiàn)階段非?;馃岬囊粋€(gè)抗凝領(lǐng)域的靶點(diǎn),開(kāi)發(fā)公司已有很多,并有多個(gè)品種進(jìn)入到臨床,國(guó)內(nèi)跟的也很緊,這里主要介紹BMS公司的咪唑類(lèi)結(jié)構(gòu),并逐漸以大環(huán)類(lèi)結(jié)構(gòu)開(kāi)發(fā)推進(jìn)。結(jié)構(gòu)優(yōu)化過(guò)程見(jiàn)下圖。
圖3.3 凝血因子FXIa抑制劑的大環(huán)結(jié)構(gòu)
4.感觸
綜上,是筆者對(duì)于大環(huán)類(lèi)結(jié)構(gòu)藥物一些初步的掃盲介紹。當(dāng)我們看到品種最終以大環(huán)結(jié)構(gòu)進(jìn)行開(kāi)發(fā)推進(jìn)的過(guò)程時(shí),除了專(zhuān)利的突破、成藥性的提升外,還有一個(gè)非常重要的因素常被忽略,那就是分子的可合成性。大環(huán)類(lèi)結(jié)構(gòu),不僅需要對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)的深入了解、分子結(jié)構(gòu)的空間柔性感知,同時(shí)還要考慮大環(huán)結(jié)構(gòu)的化學(xué)特點(diǎn)、可合成特點(diǎn),否則對(duì)于一個(gè)藥物化學(xué)研究者來(lái)說(shuō),很容易逐漸走向眼高手低的道路,脫離現(xiàn)實(shí)而不自知。所以,大環(huán)類(lèi)結(jié)構(gòu)的研究,仍是一條需多學(xué)科共同努力以推進(jìn)藥物結(jié)構(gòu)探索的路徑。
參考資料:
1. Design synthesis and biological evaluation of macrocyclic derivatives as TRK nhibitors. Sciencedirect
2. First macrocyclic 3rd-generation ALK inhibitor for treatment of ALK/ROS1 cancer: Clinical and designing strategy update of lorlatinib. Sciencedirect
3. 大環(huán)骨架在抗腫瘤藥物研究開(kāi)發(fā)中的應(yīng)用. CNKI
4. 大環(huán)小分子藥物. 郭宗儒. CNKI
5. 大環(huán)化合物在藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用及合成策略. CNKI
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