AI成藥性(ADMET)預(yù)測(cè)平臺(tái)已于今年3月全網(wǎng)開放試用。短短一個(gè)月時(shí)間已收到用戶的廣泛好評(píng)!尤其是成藥性預(yù)測(cè)結(jié)果中的——成藥性風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估的雷達(dá)圖。是個(gè)很有意思的功能。那么,這個(gè)雷達(dá)圖上的打分到底有多高的參考價(jià)值呢?
圖片來(lái)源:AI成藥性(ADMET)預(yù)測(cè)平臺(tái)
為了解答這個(gè)問題,幫助大家更清楚地了解AI成藥性(ADMET)預(yù)測(cè)平臺(tái)的雷達(dá)圖打分是怎么來(lái)的,以及它在實(shí)際應(yīng)用中的價(jià)值。我們的ADMET團(tuán)隊(duì)對(duì)藥智數(shù)據(jù)全球藥物分析系統(tǒng)中的2037個(gè)全球已經(jīng)上市的藥物分子進(jìn)行了成藥性評(píng)估。我們首先將這些藥物的分子結(jié)構(gòu)信息上傳到AI成藥性(ADMET)預(yù)測(cè)平臺(tái),然后通過(guò)全AI成藥性參數(shù)預(yù)測(cè),給出相應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)分值,很具有參考價(jià)值。接下來(lái),我們對(duì)這些風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行了分析評(píng)估:
01
毒性(TOX)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估
現(xiàn)在,我們來(lái)看看其中一個(gè)重要的風(fēng)險(xiǎn)指標(biāo)——毒性(TOX)風(fēng)險(xiǎn)。這個(gè)風(fēng)險(xiǎn)打分是結(jié)合hERG、動(dòng)物急性和慢性毒性、遺傳毒性等多個(gè)參數(shù)進(jìn)行預(yù)測(cè)的,最終形成了一個(gè)綜合的打分算法,總分為6分。我們?cè)O(shè)定了一個(gè)綠色區(qū)間,這個(gè)區(qū)間的風(fēng)險(xiǎn)分值是0到2。統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,90%的上市藥物都落在這個(gè)綠色區(qū)間內(nèi)。
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Ames風(fēng)險(xiǎn)是毒性風(fēng)險(xiǎn)的一個(gè)特殊方面。為了評(píng)估這種風(fēng)險(xiǎn),我們運(yùn)用了一種特殊的打分算法,它是基于多種菌株以及混合肝微粒體的遺傳毒性預(yù)測(cè)結(jié)果來(lái)構(gòu)建的,總分為5.4分。在設(shè)定Ames風(fēng)險(xiǎn)的標(biāo)準(zhǔn)時(shí),我們采用了更為嚴(yán)格的評(píng)判準(zhǔn)則,特別是將綠色區(qū)間的風(fēng)險(xiǎn)分值設(shè)定在0到1之間。如統(tǒng)計(jì)結(jié)果所示,即便在這樣的嚴(yán)格標(biāo)準(zhǔn)下,依然有高達(dá)84%的上市藥物分子其Ames風(fēng)險(xiǎn)值落在了綠色區(qū)間內(nèi)。
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02
代謝風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估
接下來(lái),我們的平臺(tái)還專門針對(duì)主要的CYP酶,包括1A2、2C9、2C19、2D6和3A4,以及肝細(xì)胞和肝微粒體的清除率,構(gòu)建了一個(gè)專門的CYP風(fēng)險(xiǎn)打分算法,總分為6分。這個(gè)算法的作用在于,它可以對(duì)那些在CYP代謝過(guò)程中速率較快的藥物分子進(jìn)行警示,幫助我們更好地識(shí)別這些可能具有特殊代謝特性的藥物。
在這個(gè)算法中,我們?cè)O(shè)定了一個(gè)綠色區(qū)間,其風(fēng)險(xiǎn)分值為0到2。經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì),我們發(fā)現(xiàn),有高達(dá)90%的上市藥物分子其CYP風(fēng)險(xiǎn)分值都落在了這個(gè)綠色區(qū)間內(nèi)。
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03
吸收風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估
此外,我們的平臺(tái)還根據(jù)一系列理化參數(shù),如分子量、分子體積、可旋轉(zhuǎn)鍵的數(shù)量、氫鍵受體和供體的數(shù)量、溶解度、脂溶性以及滲透性等,構(gòu)建了一個(gè)專門的吸收風(fēng)險(xiǎn)打分算法,總分為8分。這個(gè)算法能夠全面評(píng)估藥物分子的吸收風(fēng)險(xiǎn),為我們提供了一個(gè)量化的工具。
在算法中,我們?cè)O(shè)定了一個(gè)綠色區(qū)間,其風(fēng)險(xiǎn)分值為0到4。統(tǒng)計(jì)結(jié)果顯示,有87%的上市藥物分子的吸收風(fēng)險(xiǎn)打分都落在了這個(gè)綠色區(qū)間內(nèi)。
對(duì)于計(jì)劃開發(fā)口服藥物的復(fù)制研發(fā)團(tuán)隊(duì)來(lái)說(shuō),這些數(shù)據(jù)具有非常重要的參考價(jià)值。他們可以通過(guò)參考這些風(fēng)險(xiǎn)打分,更好地預(yù)測(cè)和評(píng)估藥物分子的吸收特性,從而優(yōu)化藥物設(shè)計(jì),提高藥物開發(fā)的成功率。
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04
ADMET總風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估
為了讓用戶能更直觀地了解并評(píng)估藥物的風(fēng)險(xiǎn),我們特地提供了一個(gè)ADMET總風(fēng)險(xiǎn)打分。這個(gè)打分是基于藥物的理化性質(zhì)、毒性以及代謝等多個(gè)關(guān)鍵方面的預(yù)測(cè)結(jié)果,通過(guò)一套科學(xué)的算法計(jì)算得出的,總分為22分。
為了讓用戶更容易理解這個(gè)打分,我們?cè)O(shè)定了一個(gè)綠色范圍,即0到8分。根據(jù)我們的統(tǒng)計(jì),高達(dá)95%的已經(jīng)上市的藥物,其ADMET總風(fēng)險(xiǎn)打分都落在這個(gè)綠色范圍內(nèi),也就是說(shuō),當(dāng)某個(gè)分子ADMET總風(fēng)險(xiǎn)分值大于8分時(shí),該化合物的開發(fā)風(fēng)險(xiǎn)是很高的。
這個(gè)總風(fēng)險(xiǎn)打分可以作為一個(gè)重要的參考,幫助用戶更好地了解和權(quán)衡藥物的風(fēng)險(xiǎn),從而做出更明智的決策。
圖片來(lái)源:AI成藥性(ADMET)預(yù)測(cè)平臺(tái)
最后,為了讓該成藥性預(yù)測(cè)平臺(tái)更加貼近實(shí)際研發(fā)需求,我們新增了一個(gè)非常實(shí)用的功能,叫做“真實(shí)值更新”。這個(gè)功能操作起來(lái)非常簡(jiǎn)單,您只需要將您的實(shí)驗(yàn)結(jié)果輸入到對(duì)應(yīng)的參數(shù)中,然后點(diǎn)擊一下“更新”按鈕,平臺(tái)就會(huì)立即利用這些新的數(shù)據(jù)重新為您的藥物進(jìn)行評(píng)估和打分。
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我們非常歡迎藥物研發(fā)領(lǐng)域的專業(yè)人士和研究者們來(lái)體驗(yàn)我們的預(yù)測(cè)平臺(tái)。您的每一次使用,您的每一條反饋和建議,都是我們不斷改進(jìn)和完善平臺(tái)的重要?jiǎng)恿?。我們真誠(chéng)地期待與您共同推動(dòng)藥物研發(fā)領(lǐng)域的發(fā)展,為人類的健康事業(yè)做出更大的貢獻(xiàn)。
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